Otizmin beyindeki bazı sinir sistemlerinin fonksiyon bozukluğu sonucu ortaya çıktığı düşünülmekle birlikte henüz tam olarak tanımlanamamıştır. Bu nedenle otizmle ilgili bilimsel araştırmalar, bunun neden oluştuğunu anlamaya yönelik çabalara devam ediyor. Ayrıca genetik faktörlerin ve bazı çevresel faktörlerin de otizmde rol oynadığına inanılıyor. Ancak kesin sebeplerin bunlar olduğunu söyleyemem.